Молекулярно-генетическое исследование позволяет посмотреть, есть ли в клетках поломки (мутации) в определенных генах. Эти мутации нарушают работу нормальной клетки, дают клетке особые свойства, которые превращают ее в опухолевую. В клетках меланомы существует множество мутаций, однако не все из них могут быть «мишенями» для таргетной терапии.
Значимой для терапии меланомы является мутация в гене BRAF. Если данный ген поломан, то клетка получает способность бесконтрольно делиться. Чаще всего мутация BRAF выявляется при меланомах, расположенных на туловище, на участках кожи, закрытых от воздействия солнца, у молодых пациентов.
В меланомах, возникших на открытых участках кожи, подверженных воздействию солнца, чаще встречаются такие мутации как NF1, NRAS, другие варианты мутации BRAF и KIT.
Кроме того мутация BRAF редко бывает у пожилых, а также при расположении меланомы на слизистых оболочках, стопах, ладонях, под ногтями.
Таргетную терапию можно подобрать, если обнаружены следующие мутации:
- BRAF (встречается от 30 до 70% случаев при кожной меланоме)
- KIT (встречается в 15-20% случаев при меланоме слизистых оболочек, меланомах расположенных на стопах, ладонях, под ногтями; до 5% при кожной меланоме)
- NRAS (20% случаев при кожной меланоме)
- NTRK1, NTRK2 и NTRK3 (<1% меланом)
- ALK и ROS1 (<1% меланом)
На какие маркеры нужно проводить молекулярно-генетическое исследование?
Чаще всего при меланоме кожи проводят молекулярно-генетическое исследование на наличие мутации в гене BRAF. Мутации в этом гене приводят к безудержному росту и делению клеток. Данное исследование обязательно при меланоме IIB, IIC, III стадии. При меланоме кожи IV стадии тест на мутацию BRAF также обязателен. При отсутствии мутации в гене BRAF проводится тест на мутацию в гене KIT.
KIT способствует росту и делению клеток. Мутации KIT присутствуют в 10-15% меланом слизистой оболочки, стопах, ладонях, под ногтями. Они также присутствуют на 2-3% меланом, возникающих на открытых участках кожи, подверженных воздействию солнца.
NRAS активирует пути, которые приводят к росту и делению клеток. Велика вероятность, что мутации NRAS соотносятся с плохой выживаемостью при локализованной и распространенной меланоме.
Процедура проведения молекулярно-генетического исследования
Определение мутаций в опухолевой ткани должно проводиться только в сертифицированных лабораториях. Материалом для исследования служит ДНК опухолевых клеток. Предпочтительно использовать материал из метастатической опухоли, так как терапия направлена в первую очередь именно на эти клетки. Для проведения исследования можно использовать опухолевый материал из парафиновых блоков, после проведенного гистологического исследования или сразу после проведенной биопсии. В парафиновом блоке генетический материал опухоли сохраняется на протяжении многих лет и может быть использован для молекулярно-генетического исследования даже спустя месяцы и годы после заливки в парафин.
Для проведения данных исследований необходимо, чтобы в образце было не менее 200 опухолевых клеток. Поэтому иногда необходимо повторно провести забор материала опухоли, например, при наличии метастазов меланомы в лимфоузлах или в других органах.
Существует множество способов тестирования на мутации, каждый из которых имеет свои особенности, преимущества и недостатки. Наиболее распространенным является метод ПЦР (полимеразной цепной реакции). Он обладает хорошей чувствительностью, относительно прост, но он позволяет определить за раз только одну мутацию. Более полным исследованием, позволяющим сразу в одном образце выявить все мутации, является секвенирование нового поколения (NGS), однако его недостатком является высокая стоимость. Также возможно определение мутаций методом иммуногистохимии (ИГХ) с помощью специальных антител, но считается, что данный метод не может полностью заменить проведение молекулярно-генетического исследования.
Сроки проведения исследования
Средний срок ожидания результата молекулярно-генетического исследования составляет около двух недель. Длительность выполнения секвенирования нового поколения (NGS) составляет около 1 месяца.
Важные показатели в результатах исследования
Если мутаций не выявлено — это значит, что либо мутаций в этом гене нет, либо данный метод имеет ограничения и необходимо провести секвенирование нового поколения (NGS). Если молекулярно-генетическое исследование выявило изменения в определенном гене, то возможно назначение на эту «мишень» таргетного препарата.
Что еще почитать?
- Материалы по меланоме от НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова
- Cancer Research UK: Melanoma skin cancer
- Skin Cancer Foundation: How Dangerous is Melanoma? It’s All a Matter of Timing
- https://www.cancerquest.org/cancer-biology/mutation